助教になりました (2011年度から). 研究の面でも, 他の面でも, ヒトの疾患について考える機会を多く持てる環境を維持していきたいですね.
遺伝学+バイオインフォマティクスという疾患の原因遺伝子探索から, どのような細胞内部のシステム・メカニズムの破綻により疾患の表現型が表れるのか? に興味がスライドしてきました. 自分的にそれだけ進んだということで, 良いことだと思っています.
まだまだ話題の次世代シーケンサーですが, そんなことより良い研究をするにはどうすればいいのか, 自分は何がしたいのか, ですね.
文部科学省 革新的細胞解析研究の分担研究者として参画しています (岡崎先導班).
研究費：
埼玉医科大学学内グラント 2011.11 140万円
川野小児医学奨学財団 2010.4 300万円
川野小児医学奨学財団 2009.4 240万円
科研費若手B 2009.4 130万円
科研費若手B 2008.4 190万円
著作物：
2011.9
実験医学増刊 Vol.29 No.15
使えるデータベース・ウェブツール
日本発のデータベース戦略から，ゲノム・疾患情報の有効活用まで
有田正規／編 定価 5,400円＋税 2011年9月 発行 B5判 244ページ
ISBN 978-4-7581-0317-6
2007.10
改訂第2版 バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 — 遺伝子の配列・機能解析、タンパク質解析、プロテオミクス、文献検索、検索エンジン…etc.真に役立つサイトを使い倒す！ (大型本)
International HapMap? project について執筆
RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス (単行本)
研究報告：
Homozygosity Mapping on Homozygosity Haplotype Analysis to Detect Recessive Disease-Causing Genes from a Small Number of Unrelated, Outbred Patients.
Koichi Hagiwara, Hiroyuki Morino, Jun Shiihara, Tomoaki Tanaka, Hitoshi Miyazawa, Tomoko Suzuki, Masakazu Kohda, Yasushi Okazaki, Kuniaki Seyama, Hideshi Kawakami
PLoS ONE, 査読あり, Sept., 1, 2011.
A quantitatively-modeled homozygosity mapping algorithm, HomozygosityMapping?, utilizing whole genome single nucleotide polymorphism genotyping data
Huqun, Shun-ichiro Fukuyama, Hiroyuki Morino, Hiroshi Miyazawa, Tomoaki Tanaka, Tomoko Suzuki, Masakazu Kohda, Hideshi Kawakami, Yasushi Okazaki, Kuniaki Seyama, and Koichi Hagiwara
BMC Bioinformatics., 査読あり, 11(Suppl 7), 2010.
Knockdown of COPA, identified by loss-of-function screen, induces apoptosis and suppresses tumor growth in mesothelioma mouse model.
Sudo H, Tsuji AB, Sugyo A, Kohda M, Sogawa C, Yoshida C, Harada YN, Hino O, Saga T.
Genomics., 査読あり, Vol. 95, Issue 4, 210-216, April, 2010.[PMID: 20153416]
Constitutively activated ALK-2 and increased Smad1/5 cooperatively induce BMP signaling in fibrodysplasia ossificans progressiva.
Fukuda T, Kohda M, Kanomata K, Nojima J, Nakamura A, Kamizono J, Noguchi Y, Iwakiri K, Kondo T, Kurose J, Endo K, Awakura T, Fukushi J, Nakashima Y, Chiyonobu T, Kawara A, Nishida Y, Wada I, Akita M, Komori T, Nakayama K, Nanba A, Maruki Y, Yoda T, Tomoda H, Yu PB, Shore EM, Kaplan FS, Miyazono K, Matsuoka M, Ikebuchi K, Ohtake A, Oda H, Jimi E, Owan I, Okazaki Y, and Katagiri T.
J. Biol. Chem., 査読あり, Vol. 284, Issue 11, 7149-7156, March 13, 2009.[PMID: 18684712]
Haplotype-based analysis of genes associated with risk of adverse skin reactions after radiotherapy in breast cancer patients.
Suga T, Ishikawa A, Kohda M, Otsuka Y, Yamada S, Yamamoto N, Shibamoto Y, Ogawa Y, Nomura K, Sho K, Omura M, Sekiguchi K, Kikuchi Y, Michikawa Y, Noda S, Sagara M, Ohashi J, Yoshinaga S, Mizoe J, Tsujii H, Iwakawa M, Imai T.
Int J Radiat Oncol Biol Phys., 査読あり, Vol. 69, Issue 3, 685-693, November 1, 2007.[PMID:17889263]
Homozygosity Haplotype Allows a Genomewide Search for the Autosomal Segments Shared among Patients
Hitoshi Miyazawa, Masaaki Kato, Takuya Awata, Masakazu Kohda, Hiroyasu Iwasa, Nobuyuki Koyama, Tomoaki Tanaka, Huqun, Shunei Kyo, Yasushi Okazaki, and Koichi Hagiwara
The American Journal of Human Genetics, 査読あり, Vol. 80, Issue 6, 1090–1102, Junary, 2007[PMID:17503327]
Association of the HTRA1 gene variant with age-related macular degeneration in the Japanese population.
Mori K, Horie-Inoue K, Kohda M, Kawasaki I, Gehlbach PL, Awata T, Yoneya S, Okazaki Y, Inoue S.
J Hum Genet., 査読有り, Vol. 52, Issue 7, 636-641, Junuary 14, 2007.[PMID: 17568988]
Large-scale evaluation of imprinting status in the Prader-Willi syndrome region: an imprinted direct repeat cluster resmblin small nucleolar RNA genes.
Meguro, M., Mitsuya, K., Nomura, N., Kohda, M., Kashiwagi, A., Nishigaki, R., Yoshioka, H., Nakao, M., Oishi, M. and Oshimura, M.
Hum. Mol. Genet., 査読有り, Vol. 10, Issue 4, 383-394. 10:383-394, February 15, 2001[PMID: 11157801]
Frequent loss of imprinting of IGF2 and MEST in lung adenocarcinoma.
Kohda M, Hoshiya H, Katoh M, Tanaka I, Masuda R, Takemura T, Fujiwara M, Oshimura M.
Mol Carcinog., 査読有り, Vol. 31, Issue 4, 184-191, August, 2001[PMID: 11536368]
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